Poslaním fakulty a jej afilovaných inštitútov je vedeckou metódou bádať poznatky teologickej katolíckej náuky, systematicky ich spracovávať a vysvetľovať, aby boli formujúcim činiteľom tých, ktorí v oblasti teologickej vedy pôsobia, ale aj tých, ktorí vedeckou a teologickou formáciou smerujú ku kňazstvu, alebo sa pripravujú na špeciálne služby tak v Cirkvi, ako i v celej spoločnosti.
